Licensen beviljades av tillsynsmyndigheten Anacom - National Communications Authority - till Atlantic Spaceport Consortium, som lämnade in ansökan i december.
Licensen är giltig i fem år och "avser uteslutande driften av uppskjutningscentret som ska ligga i Malbusca" på den azoriska ön Santa Maria, säger Anacom och den portugisiska rym dstyrelsen i ett gemensamt uttalande.
Detta är den första licens som Portugal beviljar för att driva en rymdhamn.
Direktören för det portugisiska konsortiet, Bruno Carvalho, sade till Lusa att efter att Anacom beviljat licensen på tisdagen förväntas de första uppskjutningarna ske våren 2026, med suborbitala flygningar för att testa teknik, drift och fordon.
Konsortiet har redan kontrakterat uppdrag, som fortfarande kräver särskild licensiering, med företag från Polen, Tyskland och Storbritannien.
Den första flygningen med "Space Rider", Europeiska rymdorganisationens obemannade rymdfärja, är planerad att landa i Santa Maria 2027.
Samma år räknar Atlantic Spaceport Consortium med att börja skicka upp satelliter i omloppsbana för att placera ut dem i rymden.
I konsortiet, som bildades 2020, ingår Ilex Space, ett företag som fokuserar på rymdverksamhet, och Optimal, en tillverkare av kompositer och metallkomponenter för satelliter och raketer.
Grunden för att skapa en rymdhamn på Azorerna lades under den dåvarande ministern för vetenskap, teknik och högre utbildning, Manuel Heitor, som till och med siktade på att de första uppskjutningarna av små satelliter skulle ske sommaren 2021.
Processen drabbades av bakslag i samband med anbudsförfarandet för byggandet och driften av infrastrukturen.
Dessutom definierades möjligheten att licensiera rymdbaser i Portugal i lagstiftningen först i februari 2024.
Enligt den lagstiftning som reglerar tillträde till och utövande av rymdverksamhet är rymdmyndigheten Anacom ansvarig för att bevilja licenser efter godkännande av regeringen.